該地區的地勢爲北高南低，河谷向南敞開，氣流可溯谷而上，受季風影響大，乾溼季節分明。且山體高峻，又形成迥然不同的垂直氣候帶。4000米雪線以上的白雪羣峯峭拔，雲蒸霞蔚。由於垂直氣候明顯，梅里的氣候變幻無常，雪雨陰晴全在瞬息之間。雨季一般在7-8月間，一月，白天7-12度，晚上零下2-5度。11月-3月，天氣非常晴朗。冬天會有幾天下雪，可能導致車輛無法通行。
而雪線以下，冰川兩側的山坡上覆蓋着茂密的高山灌木和針葉林，鬱鬱蔥蔥，與白雪相映出鮮明的色彩。林問分佈有肥沃的天然草場，竹雞、漳子、小熊貓、馬鹿和熊等動物活躍其間。
高山草甸上還盛產蟲草、貝母等珍貴藥材。梅里雪山，不僅地形複雜，氣候變化更爲複雜，每年夏季，山腳河谷氣溫可達11-29℃，高山則爲-10℃-20℃。年降水量平均爲600mm，大都集中在6—8月，此期間氣候極不穩定，是登山的氣候禁區。
